Kuşadası Belediyesi ile Aydın Büyükşehir Belediyesi arasındaki ilişkiler, 2019 yılından itibaren iş birliği ve uyum içinde gelişmiştir .
2019 yılında Kuşadası'nda yetki ve sorumluluk alanında yaşanan sorunlar, Güvercin Masa uygulaması ile çözülmüştür . Bu uygulama sayesinde, Kuşadası Belediyesi'nin iletişim merkezi olan Güvercin Masa, Aydın Büyükşehir Belediyesi'nin yetki alanındaki konularla ilgili yapılan başvuruları da alarak ilgili birimlere iletmeye başlamıştır .
Ayrıca, Aydın Büyükşehir Belediyesi ile Kuşadası Belediyesi, temizlik, fen işleri, park ve bahçeler gibi alanlarda iş birliği yaparak koordineli çalışmaya başlamıştır .
Ancak, 2025 yılında Aydın Büyükşehir Belediye Başkanı Özlem Çerçioğlu'nun, CHP'den AKP'ye geçmesinin ardından, Kuşadası Belediyesi'ne tahsis edilen hizmet binasının zemin katı için tahliye kararı aldığı ve bu durumun iki belediye arasında gerilime yol açtığı belirtilmiştir .