Gemiler Adası'ndaki kiliseler, 5. ve 7. yüzyıllar arasında yerleşime sahne olmuş ve bu dönemde inşa edilmiştir .
Adada bulunan kiliselerden 2 numaralı kilisenin apsis kısmında yer alan bir freskoda "Hossios Nikolaos" yazmaktadır . Buradan hareketle, kilisenin günümüzde Antalya Demre yakınlarındaki Alacahisar’da (Sion) doğmuş ve yaşamış olan Sionlu Aziz Nikolaos’a atfen inşa edildiği düşünüldüğünden, Aziz Nikolaos Kilisesi olarak adlandırılmıştır .
Adada yapılan kazılarda hem dini hem de ticari geçmişe dair izlere rastlanmıştır . Tarihte ticaret gemilerinin duraksadığı, alışveriş yaptığı bir yer olduğu tespit edilmiştir . Bu durum, adayı yalnızca dini değil ticari anlamda da önemli bir merkez haline getirmektedir .
MS 5-13. yüzyıllar arasında yerleşim bulunduğu anlaşılan Gemile Adası ve çevresinde bu derece fazla dini yapıların olması, 5. ve 7. yüzyılda, Ön Asya’dan, Ege ve Akdeniz sahillerine deniz yoluyla yapılan hac seferlerinin artması olabileceği gibi eski çağ ve Bizans’ın Yakın Doğu ve Avrupa ile deniz ticareti açısından da ilişkisini ortaya koymaktadır .
Ada, 7. yüzyıldaki Arap akınları sonrası terk edilmiştir .